Фактор некроза опухоли

Фактор некроза опухоли
PDB rendering based on 1TNF.
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB Список идентификаторов PDB 1A8M, 1TNF, 2AZ5, 2E7A, 2TUN, 2ZJC, 2ZPX, 3ALQ, 3IT8, 3L9J, 3WD5, 4G3Y, 4TSV, 4TWT, 5TSW
Идентификаторы
Символ	TNF ; DIF; TNF-alpha; TNFA; TNFSF2
Внешние ID	OMIM: 191160 MGI: 104798 HomoloGene: 496 ChEMBL: 1825 GeneCards: TNF Gene
Генная онтология Функция • protease binding • cytokine activity • tumor necrosis factor receptor binding • protein binding • identical protein binding • transcription regulatory region DNA binding Компонент клетки • phagocytic cup • extracellular region • extracellular space • plasma membrane • integral component of plasma membrane • external side of plasma membrane • cell surface • membrane raft • recycling endosome Биологический процесс • protein import into nucleus, translocation • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • MAPK cascade • activation of MAPKKK activity • activation of MAPK activity • positive regulation of cytokine production • positive regulation of protein phosphorylation • chronic inflammatory response to antigenic stimulus • negative regulation of cytokine secretion involved in immune response • positive regulation of chronic inflammatory response to antigenic stimulus • positive regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin • glucose metabolic process • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • transformed cell apoptotic process • inflammatory response • humoral immune response • cell surface receptor signaling pathway • JNK cascade • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • response to virus • response to salt stress • positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • negative regulation of alkaline phosphatase activity • negative regulation of lipid storage • extracellular matrix organization • osteoclast differentiation • sequestering of triglyceride • positive regulation of protein complex assembly • positive regulation of fever generation • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • negative regulation of interleukin-6 production • positive regulation of chemokine production • positive regulation of interferon-gamma production • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of interleukin-8 production • receptor biosynthetic process • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion • positive regulation of NF-kappaB import into nucleus • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of programmed cell death • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of protein complex disassembly • positive regulation of protein complex disassembly • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of MAP kinase activity • protein kinase B signaling • positive regulation of JUN kinase activity • negative regulation of growth of symbiont in host • negative regulation of viral genome replication • positive regulation of chemokine biosynthetic process • positive regulation of interleukin-8 biosynthetic process • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • negative regulation of fat cell differentiation • negative regulation of myoblast differentiation • negative regulation of osteoblast differentiation • positive regulation of osteoclast differentiation • positive regulation of cell adhesion • positive regulation of protein kinase activity • negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • positive regulation of translational initiation by iron • negative regulation of glucose import • embryonic digestive tract development • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • positive regulation of cytokine secretion • positive regulation of phagocytosis • regulation of insulin secretion • defense response to Gram-positive bacterium • leukocyte tethering or rolling • negative regulation of lipid catabolic process • regulation of immunoglobulin secretion • positive regulation of membrane protein ectodomain proteolysis • positive regulation of sequence-specific DNA binding transcription factor activity • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of protein transport • response to glucocorticoid • positive regulation of NFAT protein import into nucleus • positive regulation of hair follicle development • positive regulation of protein kinase B signaling • positive regulation of vitamin D biosynthetic process • positive regulation of calcidiol 1-monooxygenase activity • epithelial cell proliferation involved in salivary gland morphogenesis • regulation of branching involved in salivary gland morphogenesis • negative regulation of branching involved in lung morphogenesis • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to amino acid stimulus • cellular response to nicotine • cellular response to organic cyclic compound • death-inducing signaling complex assembly • positive regulation of mononuclear cell migration • positive regulation of podosome assembly • extrinsic apoptotic signaling pathway • necroptotic signaling pathway • positive regulation of protein localization to cell surface • positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	7124	21926
Ensembl	ENSG00000204490	ENSMUSG00000024401
UniProt	P01375	P06804
RefSeq (мРНК)	NM_000594	NM_001278601
RefSeq (белок)	NP_000585	NP_001265530
Локус (UCSC)	Chr 6: 31.58 – 31.58 Mb	Chr 17: 35.2 – 35.2 Mb
Поиск в PubMed	[1]	[2]

Фа́ктор некро́за о́пухоли (ФНО, фактор некроза опухоли-альфа, кахексин, кахектин, англ. tumor necrosis factor, TNF) — внеклеточный белок, многофункциональный провоспалительный цитокин, синтезирующийся в основном моноцитами и макрофагами. Влияет на липидный метаболизм, коагуляцию, устойчивость к инсулину, функционирование эндотелия, стимулирует продукцию ИЛ-1, ИЛ-6, ИЛ-8, интерферона-гамма, активирует лейкоциты, один из важных факторов защиты от внутриклеточных паразитов и вирусов. Впервые был обнаружен в сыворотке мышей, которым были введены БЦЖ и эндотоксин. Сыворотка из таких мышей обладала цитотоксическим и цитостатическим действием на некоторые трансформированные клеточные линии, а также вызывала геморрагический некроз и уменьшение привитых опухолей у мышей. Активирует ядерный транскрипционный фактор NF-κB. Избыточная продукция ФНО вызывает расстройства гемодинамики (снижает сократимость миокарда, минутный объем крови, диффузно увеличивает проницаемость капилляров), цитотоксический эффект на клетки организма. Нарушения регуляции ФНО у человека ассоциированы с различными заболеваниями, такими как болезнь Альцгеймера, рак, клиническая депрессия, псориаз и воспалительные заболевания кишечника (болезнь Крона, язвенный колит).

Терминология

Происхождение термина связано с тем, что in vitro ФНО вызывает некроз некоторых опухолей. В современной терминологии фактором некроза опухоли называют белок, ранее называвшийся «фактор некроза опухоли-альфа» (ФНО-α). Впрочем, до сих пор иногда используется старый термин ФНО-альфа, хотя ФНО и ФНО-альфа означают один и тот же белок. ФНО является прототипом для целого суперсемейства, которое включает 18 различных белков, служащих лигандами для 29 рецепторов. Один из членов этого суперсемейства, лимфотоксин-альфа, ранее назывался ФНО-бета (ФНО-β).

Структура

ФНО синтезируется как мембранный белок с молекулярной массой 26 кДа (233 аминокислоты). После действия специфической металлопротеазы, т. н. ФНО-конвертирующего фермента (ADAM17), мембрано-связывающий фрагмент отщепляется и образуется растворимый ФНО с молекулярной массой 17 кДа (157 аминокислот). Активной формой белка является гомотример, теряющий активность при диссоциации субъединиц, так как только тример способен связываться с рецептором и олигомеризовать его, что необходимо для запуска сигнального пути. Молекула цитокина образует бета-складчатую структуру.

Генетические варианты

Ген человеческого ФНО-α (TNF-α) был клонирован в 1985 году. Ген картирован на хромосоме 6p21.3, имеет размер 2762 п.н. и содержит 4 экзона. Последний экзон более, чем на 80 % кодирует белок. Известны более 30 полиморфных вариантов гена (микросателлиты, SNP-полиморфизмы), но только около половины из них влияют на экспрессию ФНО-α in vitro.

Терапевтическое значение

Антагонисты TNF (в частности, этанерцепт, инфликсимаб, адалимумаб) широко используются в качестве средств для лечения псориаза. Несмотря на значительный риск развития инфекций и злокачественных новообразований, требующий от врача тщательной оценки возможных последствий, антагонисты TNF в 2014 году составляли половину мирового рынка антипсориатических лекарств.

См. также

• Факторы некроза опухоли
• Интерлейкин 1
• Ингибиторы ФНО
• TRAF6